חברות בחברה מותנית בחברות בהר"י, למעט חברי חוץ, וחבר שלא מן המניין. בחברה 4 סוגי חברויות: חבר מן המניין, חבר שלא מן המניין, חבר חוץ וחבר כבוד.
- חבר מן המניין - יוכלו להתקבל בזכויות מלאות כל חבר הר"י מן המניין העוסק בתחומי המחקר, ההוראה, מיון ומעקב רפואי (פיקוח רפואי), הומיאופתיה, רפואה סינית מסורתית (לרבות אקופונקטורה), צמחי מרפא, נטורופתיה, ביופידבק, חיפנוזה, רפלקסולוגיה. הוועד המכהן יהיה מוסמך להוסיף תחומי עיסוק נוספים, על פי הנתונים שייתוספו ובאישור הר"י.
- כחבר שלא מן המניין - מי שאינם רופאים ובלבד שלאלה האחרונים לא תהיה זכות להיבחר למוסדות החברה.
- חבר חוץ - רופא המוכר על ידי איגוד מקצועי מוכר בארץ מגוריו ומבקש להיות חבר בחברה, או חבר מן המניין שייעדר מן הארץ לתקופה של יותר משנתיים ומבקש להיות חבר חוץ בחברה.
- חבר כבוד - חבר אשר החברה מבקשת להעניק לו הוקרה עקב תרומתו המיוחדת למקצוע בארץ. חברות כבוד תוענק על-ידי ועד החברה ברוב של לפחות שני-שליש מחברי הוועד.